高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒JL株Nsp10基因生物信息学分析

【引言】猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒（ｐｏｒｃｉｎｅ　ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｅ　ａｎｄ　ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ　ｓｙｎｄｒｏｍｅ　ｖｉｒｕｓ，ＰＲＲＳＶ）属于套式病毒目、动脉炎病毒科、动脉炎病毒属，可引起妊娠母猪早产、流产、死胎、木乃伊胎等繁殖障碍及各种年龄猪呼吸系统疾病，仔猪高死亡率、感染猪出现免疫抑制等。自２００５年以来，中国开始流行以“高热病”为特征的高致病性猪繁殖与呼吸综合征变异毒株（ＨＰ－ＰＲＲＳＶ），其致病力大、感染力强，给中国养猪业造成了巨大的经济损失（杨汉春等，２００１；刘金霞等，２００７）。ＰＲＲＳＶ基因组长度约１５ｋｂ，含有８个开放阅读框（ＯＲＦｓ），其基因组顺序依次为：５′－ＯＲＦ１ａ－ＯＲＦ１ｂ－ＯＲＦ（２－６）－ＯＲＦ７－３′（Ｚｈａｎｇ等，２００９），３Ｃ样丝氨酸蛋白酶（３Ｃ－ｌｉｋｅ　ｓｅｒｉｎｅ　ｐｒｏｔｅｉｎａｓｅｓ，３ＣＬＳＰ）将ＯＲＦ１ｂ编码的多肽切割成Ｎｓｐ９、Ｎｓｐ１０、Ｎｓｐ１１、Ｎｓｐ１２等４个非结构蛋白，这些蛋白形成复制酶复合体，同步完成动脉炎病毒基因组的复制和亚基因组转录（韦祖樟等，２００８）。其中Ｎｓｐ１０由其Ｃ端的超家族１（ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ１，ＳＦ１）解旋酶（ｈｅｌｉｃａｓｅ，Ｈｅｌ）结构域和收稿日期：２０１１－０６－２３作者简介：周思旋（１９８４―），女，江西人，研究实习员，硕士，研究方向：兽医微生物与传染病。通信作者：徐健（１９８５―），男，硕士。Ｅ－ｍａｉｌ：３５０８７０８２＠ｑｑ．ｃｏｍ基金项目：国家自然科学基金项目资助“三带喙库蚊作为ＰＲＲＳＶ生物媒介可能性实验研究”（３１０７２１５８）；贵州省农业攻关项目“贵州省猪繁殖与呼吸综合症防控研究与应用”［黔科合ＮＹ字（２００９）３０７１号］。Ｎ端锌结合结构域（ｚｉｎｃ－ｂｉｎｇｉｎｇ　ｄｏｍａｉｎ，ＺＢＤ）组成（Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ等，２００６）。目前有关Ｎｓｐ１０的研究尚少，本研究在对ＰＲＲＳＶ 贵州分离株ＪＬ株Ｎｓｐ１０基因克隆测序的基础上，对其基因编码蛋白进行生物信息学分析，了解其生化及结构特征，为下一步对该基因进行表达和建立ＥＬＩＳＡ检测方法奠定基础。